Απέναντι από τον αρχαιολογικό χώρο στον Ορχομενό, στο νομό Βοιωτίας βρίσκεται η μονή Παναγία Σκριπού.
Η Παναγία Σκριπού πιθανότατα δημιουργήθηκε τον 9ο αιώνα σαν ταφικό μνημείο του βυζαντινού χορηγού της, Λέοντα, και είναι αφιερωμένη στην Κοίμηση της Θεοτόκου. Στη θέση της μάλλον προϋπήρχε αρχαίος ναός του Διονύσου, ερείπια του οποίου έχουν ανακαλυφθεί στο προαύλιο της εκκλησίας.
Η Παναγία Σκριπού που είναι το αρχαιότερο βυζαντινό μνημείο σε ολόκληρη τη Βοιωτία, πιθανολογείται ότι πήρε το όνομά της από το λατινικό Scriptus που σημαίνει επιγραφή, εξαιτίας των πολλών επιγραφών που βρίσκονται εντοιχισμένες στο κτίριο.
Στην Παναγία Σκριπού ξεχωρίζει το κατακόρυφο ηλιακό ρολόι, πιθανότατα το αρχαιότερο της μεσαιωνικής περιόδου, σκαλισμένο επάνω στο κτίριο του ναού. Μια ενδιαφέρουσα ιστορία-θρύλος για την μονή Παναγία Σκριπού προέρχεται από τον Β’ Παγκόσμιο Πόλεμο. Τότε γερμανικά άρματα μάχης που ετοιμαζόντουσαν να χτυπήσουν τους Έλληνες ακινητοποιήθηκαν ακριβώς έξω από την Παναγία Σκριπού. Ο Γερμανός αξιωματικός ισχυρίστηκε ότι είδε όραμα με την Παναγία που τον διέταξε να σταματήσει. Από τότε εκτός από τις καθιερωμένες γιορτές της Ορθοδοξίας, η Παναγία Σκριπού γιορτάζει και στις 10 Σεπτεμβρίου σε ανάμνηση αυτού του γεγονότος.